ÖZET
AMAÇ: Şizofrenide DNA tamir mekanizmalarının rolü, son zamanlarda dikkat çekmektedir. Şizpfreni (Sch) hastaları yüksek oranda nikotin bağımlılığı (NB)göstermektedir. Bu çalışma ile, XRCC1 ve XPD ‘de fonksiyonel SNP varyantlarının silikoanaliz yaklaşımıyla takip edilmekte olan, hem NB hem de Sch + NB hastalarının etiyopatogenezinde herhangi bir rolü olup olmadığının araştırılması amaçlanmıştır.
YÖNTEM: XRCC1 rs25487 ve XPD rs13181 varyantları polimeraz czincir reaksiyon-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) kullanılarak belirlendi. rs25487 ve rs13181 SNPs’nin patogenetik etkisini öngörmede; PANTHER ve SNPs&GO programları kullanıldı. Aynı zamanda, XRCC1 ve XPD proteinlerin fonksiyonel eşlerini bulmak için protein–protein etkileşim analizi yapıldı.
BULGULAR: hem NB hem de Sch + NB gruplarında XRRC1 rs25487 GG genotipi kontrollerden daha düşüktü (p = .001, p = .006) G alleli, kontrollere kıyasla sadece Sch + NB grubunda belirgin olarak daha düşükken (p = .034). XPD rs13181 Lys/Lys genotype hem Sch + NB hem de NB gruplarındakontrollere kıyasla çok daha düşüktü (p = .007; p = .001). XPD rs13181 Gln allel, kontrole kıyasla Sch + NB grubunda daha düşüktü, oysa ki Lys alleli kontrollere kıyasla NB grubunda daha yüksekti (p = .034; p = .008). Silico öngörü analizindeki bulgular rs13181 hastalıkla ilşkili bir etki gösterirken rs25487 nötral bir etki gösterdi.
TARTIŞMA: Bu çalışmanın sonuçları, XRCC1/XPD varyantları ile hem NB hem de Sch + NB arasında olası bir genetik ilişki olduğunu ortaya koydu. Biyoinformatik yöntemleri kullanarak bu yanlış anlamlı SNPlerin analizinin, XRCC1 ve XPD-ilişkili hastalıkların teşhisinde yardımcı olabileceğini düşünüyoruz.